Im Pokémon-Dorf kommt es zum erneuten Duell zwischen X und Flordelis,
dem Oberhaupt von Team Flare! Gegenüber Flordelis, der Esprit und das dritte Legendäre Pokémon Zygarde in den Kampf schickt, verfolgt X einen geheimen Plan ...
Die Story steuert unaufhaltsam auf ihr spektakuläres Ende zu.